Una Nueva Familia de Topologías Indirectas, Eficientes y Tolerantes a Fallos

[EN] Large parallel computers are currently adopting the cluster architecture as the basis for their construction. These machines are being built with thousands of processing nodes that are interconnected through high-speed interconnection networks. Performance, fault tolerance and network cost are key factors in the overall design of these systems. The levels of computing power required can only be reached by increasing the number of network nodes. As systems grow, however, so does the amount of network components and with it, the probability of network faults. Since availability is important with these computer systems, fault-tolerance mechanisms are often implemented that are based on increasing network size and duplicating components, which directly affects cost. In the field of interconnection networks, indirect topologies are often the design of choice for HPC systems. The most commonly used indirect topology is the fat-tree, which is a multi-stage bidirectional-link topology providing good network performance and high fault-tolerance levels, but at a high cost. To reduce cost, RUFT has been proposed, a multi-stage unidirectional topology providing network performance similar to that of the fat-tree but using fewer hardware resources (approximately half). RUFTs weak point, however, is that it has zero fault tolerance. This work focuses on designing a simple indirect topology that offers high performance and fault tolerance while keeping hardware cost as low as possible. In particular, we propose a set of new topologies with different properties in terms of cost, performance and fault tolerance. All of them are capable of achieving performances similar to or better than that of the fat-tree, while also providing good fault tolerance levels and tolerating faults in the links connecting to end nodes, which most available topologies cannot do. Our first contribution is RUFT-PL, a topology that duplicates the number of injection, network and ejection links, while using the RUFT connection pattern to interconnect all network elements. This topology provides high network performance and a slight level of fault tolerance, using the same hardware resources as a fat-tree. Our second contribution is the FT-RUFT-212 topology, which provides better network performance than the fat-tree, as well as good fault tolerance for a low design cost, thanks to the proposed injection/ejection system implemented by the processing nodes. The third contribution, FT-RUFT-222, is a topology combining the best properties of the previous two proposals. In particular, this topology implements the injection/ejection used by FT-RUFT-212 and the double network links used by RUFT-PL to interconnect the switches. It provides high performance and fault-tolerance levels while using the same hardware resources required by a fat-tree. Our fourth and last contribution is FT-RUFT-XL, a topology in which both the injection/ejection and the connection between the switches have been redesigned. It offers a significant improvement on the other proposals' fault-tolerance levels, and also provides high network performance. Furthermore, unlike many unidirectional topologies, it allows packets to take different routes at every network stage, always bringing them closer to their destination with each hop.[ES] Actualmente, los grandes sistemas de cómputo paralelo están adoptando la arquitectura de cluster como base de su construcción (lista Top500). Estos clusters están siendo construidos con miles de nodos de procesamiento, los cuales se conectan a través de una red de interconexión de altas prestaciones. En estos sistemas, el rendimiento, la tolerancia a fallos y el coste de la red juegan un factor clave en el diseño de todo el sistema. Los niveles de cómputo requeridos solo pueden ser alcanzados incrementando el número de nodos que lo componen. Sin embargo, a medida que el sistema crece también lo hace la cantidad de componentes de la red, y con ello la probabilidad de un fallo en la misma. Dado que la disponibilidad de estos sistemas es una preocupación, los mecanismos de tolerancia a fallos son implementados regularmente basados en el aumento y replicación de componentes, afectando de forma directa a su coste. En este campo, las topologías indirectas a menudo son elegidas en el diseño de clusters de alto rendimiento. Entre ellas, la más utilizada es el fat-tree, la cual es una topología bidireccional multietapa que provee un buen rendimiento de red y un buen nivel de tolerancia a fallos, pero a un alto coste. Para reducir su coste, se propuso RUFT, una topología unidireccional multietapa que obtiene un rendimiento de red similar al fat-tree, utilizando menos recursos de hardware (aproximadamente la mitad). Sin embargo, el punto débil de RUFT es que no ofrece ningún tipo de tolerancia a fallos. En este trabajo, nos enfocamos en diseñar una topología indirecta que ofrezca un alto rendimiento de red y sea tolerante a fallos, a la vez que mantiene un bajo coste del hardware. En particular, proponemos una nueva familia de topologías indirectas con diferentes propiedades en términos de coste, rendimiento y tolerancia a fallos. Estas nuevas topologías son capaces de alcanzar un rendimiento similar o mejor al ofrecido por el fat-tree, además de ofrecer un buen nivel de tolerancia a fallos y, a diferencia de la mayoría de topologías disponibles, también son capaces de tolerar fallos en los enlaces que conectan con los nodos de procesamiento. Nuestra primera contribución es RUFT-PL, una topología que duplica los enlaces de inyección, red y eyección, siguiendo el mismo patrón de conexión utilizado por RUFT para interconectar todos los elementos de la red. Esta topología obtiene un alto rendimiento de red y un ligero grado de tolerancia a fallos, usando los mismos recursos de hardware que el fat-tree. Como segunda contribución, proponemos la topología FT-RUFT-212. Esta topología incrementa el rendimiento de red con respecto al fat-tree, ofreciendo además un buen nivel de tolerancia a fallos a un bajo coste de diseño, gracias al sistema de inyección/eyección propuesto que implementan los nodos de procesamiento. La tercera contribución, FT-RUFT-222, es una topología que aprovecha las mejores propiedades de las dos propuestas anteriores. En particular, esta topología implementa la inyección/eyección utilizada por FT-RUFT-212 y los dobles enlaces de red de RUFT-PL para conectar los conmutadores. Esta propuesta ofrece un alto rendimiento de red y de tolerancia a fallos, utilizando los mismos recursos de hardware requeridos por el fat-tree. Nuestra última contribución es FT-RUFT-XL, una topología que rediseña tanto la inyección/eyección como la conexión entre los conmutadores. Esta topología incrementa notablemente el nivel de tolerancia a fallos ofrecido por las demás propuestas, ofreciendo también un alto rendimiento de red. Además, a diferencia de muchas topologías unidireccionales, ésta permite que los paquetes tomen diferentes rutas en cada etapa de la red, acercándolos siempre a su destino en cada salto.[CA] Actualment, els grans sistemes de còmput paral¿lel estan adoptant l'arquitectura cluster com a base per la seua construcció (Llista Top500). Aquests clusters estan sent construïts amb milers de nodes de processament, els quals es connecten mitjançant una xarxa d'interconnexió d'altes prestacions. En aquests sistemes, el rendiment, la tolerància a fallades i el cost de la xarxa són un factor clau en el disseny de tot el sistema. Per altra banda, els nivells de còmput requerits només poden ser aconseguits incrementant el nombre de nodes que componen el cluster. Per tant, a mesura que el sistema creix també ho fa la quantitat de components de la xarxa, i amb això la probabilitat d'una fallada en la mateixa. Atès que la disponibilitat d'aquests sistemes és una gran preocupació, és habitual que les xarxes d'interconnexió implementen mecanismes de tolerància a fallades, que solen consistir en l'augment i replicació de components, incrementant el cost total de la xarxa. En aquest camp, les topologies indirectes sovint són triades en el disseny de clusters d'alt rendiment. Entre elles, la més utilitzada és el fat-tree, una topologia bidireccional multietapa que presenta un bon rendiment de xarxa i un bon nivell de tolerància a fallades, però a un alt cost. Per reduir aquest cost, es va proposar RUFT, una topologia unidireccional multietapa que obté un rendiment de xarxa similar al fat-tree utilitzant menys recursos hardware (aproximadament la meitat). No obstant això, el punt feble de RUFT és que no ofereix cap tipus de tolerància a fallades. En aquest treball, ens centrem en dissenyar una topologia indirecta que, per una banda, aconseguisca un alt rendiment de xarxa i siga tolerant a fallades i, per altra banda, tinga un baix cost. Concretament, proposem una nova família de topologies indirectes amb diferents propietats pel que fa a cost, rendiment i tolerància a fallades. Aquestes noves topologies obtenen un rendiment similar o millor al que ofereix el fat-tree, a més d'oferir un bon nivell de tolerància a fallades. A més, a diferència de la majoria de topologies disponibles, toleren fallades en els enllaços que connecten amb els nodes de processament. La nostra primera contribució és RUFT-PL, una topologia que duplica els enllaços d'injecció, xarxa i ejecció, seguint el mateix patró de connexió utilitzat per RUFT per interconnectar tots els elements de la xarxa. Aquesta topologia obté un alt rendiment de xarxa i un lleuger grau de tolerància a fallades, emprant els mateixos recursos de hardware que el fat-tree. Com a segona contribució, proposem la topologia FT-RUFT-212. Aquesta topologia incrementa el rendiment de xarxa respecte al fat-tree, oferint a més a més un bon nivell de tolerància a fallades amb un baix cost de disseny, gràcies al sistema d'injecció/ejecció proposat que implementen els nodes de processament. La tercera contribució, FT-RUFT-222, és una topologia que aprofita les millors propietats de les dues propostes anteriors. En particular, aquesta topologia implementa la injecció/ejecció utilitzada per FT-RUFT-212 i els dobles enllaços de xarxa de RUFT-PL per a connectar els commutadors. Aquesta proposta ofereix un alt rendiment de xarxa i de tolerància a fallades, utilitzant els mateixos recursos hardware requerits pel fat-tree. La nostra última contribució és FT-RUFT-XL, una topologia que redissenya tant la injecció / ejecció com la connexió entre els commutadors. Aquesta topologia incrementa notablement el nivell de tolerància a fallades oferit per les altres propostes, presentant alhora un elevat rendiment de xarxa. A més a més, a diferència de moltes topologies unidireccionals, aquesta permet que els paquets prenguin rutes diferents en cada etapa de la xarxa, acostant-se sempre al seu destí en cada salt.Bermúdez Garzón, DF. (2015). Una Nueva Familia de Topologías Indirectas, Eficientes y Tolerantes a Fallos [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/59386TESI

Speeding-up the fault-tolerance analysis of interconnection networks

© 2015 IEEE. Personal use of this material is permitted. Permission from IEEE must be obtained for all other uses, in any current or future media, including reprinting/republishing this material for advertising or promotional purposes, creating new collective works, for resale or redistribution to servers or lists, or reuse of any copyrighted component of this work in other worksAnalyzing the fault-tolerance of interconnection networks implies checking the connectivity of each sourcedestination pair. The size of the exploration space of such operation skyrockets with the network size and with the number of link faults. However, this problem is highly parallelizable since the exploration of each path between a source–destination pair is independent of the other paths. This paper presents an approach to analyze the fault-tolerance degree of multistage interconnection networks using GPUs in order to speed-up it. This approach uses CUDA as parallel programming tool on a GPU in order to take advantage of all available cores. Results show that the execution time of the fault-tolerance exploration can be significantly reduced.This work was supported by the Spanish Ministerio de Economía y Competitividad (MINECO) and by FEDER funds under Grant TIN2012-38341-C04-01.Bermúdez Garzón, DF.; Gómez Requena, C.; López Rodríguez, PJ.; Gómez Requena, ME. (2015). Speeding-up the fault-tolerance analysis of interconnection networks. IEEE. https://doi.org/10.1109/HPCSim.2015.7237035

A Family of Fault-Tolerant Efficient Indirect Topologies

© 2016 IEEE. Personal use of this material is permitted. Permission from IEEE must be obtained for all other uses, in any current or future media, including reprinting/republishing this material for advertising or promotional purposes, creating new collective works, for resale or redistribution to servers or lists, or reuse of any copyrighted component of this work in other works.On the one hand, performance and fault-tolerance of interconnection networks are key design issues for high performance computing (HPC) systems. On the other hand, cost should be also considered. Indirect topologies are often chosen in the design of HPC systems. Among them, the most commonly used topology is the fat-tree. In this work, we focus on getting the maximum benefits from the network resources by designing a simple indirect topology with very good performance and fault-tolerance properties, while keeping the hardware cost as low as possible. To do that, we propose some extensions to the fat-tree topology to take full advantage of the hardware resources consumed by the topology. In particular, we propose three new topologies with different properties in terms of cost, performance and fault-tolerance. All of them are able to achieve a similar or better performance results than the fat-tree, providing also a good level of fault-tolerance and, contrary to most of the available topologies, these proposals are able to tolerate also faults in the links that connect to end nodes.This work was supported by the Spanish Ministerio de Economia y Competitividad (MINECO) and by FEDER funds under Grant TIN2012-38341-C04-01.Bermúdez Garzón, DF.; Gómez Requena, C.; Gómez Requena, ME.; López Rodríguez, PJ.; Duato Marín, JF. (2016). A Family of Fault-Tolerant Efficient Indirect Topologies. IEEE Transactions on Parallel and Distributed Systems. 27(4):927-940. https://doi.org/10.1109/TPDS.2015.2430863S92794027

Evaluación y optimización de criterios para la selección de ruta en redes inalámbricas de sensores

Optimizar rutas de encaminamiento en redes inalámbricas de sensores en protocolos basados en conexión tipo árbol.Bermúdez Garzón, DF. (2008). Evaluación y optimización de criterios para la selección de ruta en redes inalámbricas de sensores. http://hdl.handle.net/10251/13180Archivo delegad

Memorias. Encuentro de Experiencias en Inventarios y Monitoreo Biológico

Las discusiones temáticas alrededor de la consolidación del Inventario Nacional de Biodiversidad para Colombia y la Red de Monitoreo de Biodiversidad como una estrategia de largo plazo, sin duda temas complejos que requerirán de grandes esfuerzos, coordinación y generosidad institucional y personal, los podrá apreciar el lector a lo largo del presente documento, esperando que pueda entender también la importancia que tienen los resultados y la agenda propuesta si en el futuro queremos tomar decisiones con bases científicas